Auf die schnelle viele Datenbankwerte ändern ohne sich totzuklicken ;)
UPDATE tablename SET tablefield = replace(tablefield, "findstring", "replacestring");
Doppelte Systemmenüeinträge die man nicht normal übers den admin Bereich löschen kann (zuerst versuchen diese zurückzusetzen und dann zu löschen) können einfach und effektiv via phpmyadmin gelöscht werden:
DELETE FROM `menu_links` WHERE `menu_links`.`module` = 'admin_menu'
DELETE FROM `menu_links` WHERE `menu_links`.`module` = 'system'
Danach einfach admin/build/modules aufrufen.